Fundado em 2000 com o nome de Colorado, o clube conquistou o Campeonato Candango Amador em 2002 ainda como Colorado/Paranoá. Após essa vitória, o time se profissionalizou e adotou o nome atual, Paranoá Esporte Clube.
**Paranoá Esporte Clube**
Com a profissionalização em 2002 e a nova identidade, o Paranoá viveu um grande momento em 2004, ao vencer o Campeonato Brasiliense da Segunda Divisão e garantir seu lugar pela primeira vez na elite do Campeonato Brasiliense. Em 2016, sob uma nova gestão e em parceria com a Faculdade UPIS, o clube alcançou o vice-campeonato da Segunda Divisão e, no ano seguinte, competiu na Primeira Divisão profissional do DF, consolidando-se na elite do futebol de Brasília. Também em 2016, o Paranoá sagrou-se campeão brasiliense de juniores, o que lhe garantiu vaga na Copa São Paulo de Futebol Júnior de 2017.
Em 2021, o clube passou por uma atualização em seu escudo.
